Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSC2Q02487 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSC2Q02487 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DSC2Q02487 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSC2Q02487 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSC2Q02487 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DSC2Q02487 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSC2Q02487 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms