Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ROR1Q01973 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ROR1Q01973 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ROR1Q01973 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ROR1Q01973 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ROR1Q01973 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ROR1Q01973 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ROR1Q01973 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ROR1Q01973 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ROR1Q01973 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ROR1Q01973 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ROR1Q01973 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ROR1Q01973 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ROR1Q01973 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ROR1Q01973 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ROR1Q01973 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ROR1Q01973 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ROR1Q01973 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ROR1Q01973 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ROR1Q01973 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ROR1Q01973 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ROR1Q01973 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms