Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNC1Q01954 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BNC1Q01954 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC1Q01954 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNC1Q01954 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms