Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SATB1Q01826 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SATB1Q01826 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SATB1Q01826 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SATB1Q01826 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SATB1Q01826 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms