Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA6Q01524 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DEFA6Q01524 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms