Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRCDQ00LT1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRCDQ00LT1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRCDQ00LT1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRCDQ00LT1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRCDQ00LT1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRCDQ00LT1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRCDQ00LT1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRCDQ00LT1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRCDQ00LT1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms