Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4GALNT1Q00973 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
B4GALNT1Q00973 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4GALNT1Q00973 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
B4GALNT1Q00973 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms