Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP2R2BQ00005 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPP2R2BQ00005 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP2R2BQ00005 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms