Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX4P78413 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX4P78413 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX4P78413 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX4P78413 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX4P78413 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX4P78413 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX4P78413 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX4P78413 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX4P78413 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX4P78413 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX4P78413 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX4P78413 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX4P78413 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX4P78413 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX4P78413 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX4P78413 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX4P78413 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX4P78413 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX4P78413 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX4P78413 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX4P78413 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX4P78413 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX4P78413 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
IRX4P78413 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX4P78413 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX4P78413 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX4P78413 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX4P78413 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX4P78413 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX4P78413 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX4P78413 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX4P78413 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX4P78413 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX4P78413 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX4P78413 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX4P78413 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX4P78413 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX4P78413 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX4P78413 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX4P78413 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX4P78413 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX4P78413 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX4P78413 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX4P78413 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX4P78413 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX4P78413 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX4P78413 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX4P78413 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX4P78413 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX4P78413 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX4P78413 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX4P78413 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX4P78413 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX4P78413 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX4P78413 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX4P78413 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX4P78413 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX4P78413 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX4P78413 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX4P78413 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX4P78413 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX4P78413 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX4P78413 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX4P78413 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX4P78413 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX4P78413 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX4P78413 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX4P78413 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX4P78413 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX4P78413 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX4P78413 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX4P78413 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX4P78413 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX4P78413 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX4P78413 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX4P78413 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX4P78413 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX4P78413 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX4P78413 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX4P78413 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX4P78413 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX4P78413 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX4P78413 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX4P78413 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX4P78413 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX4P78413 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX4P78413 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX4P78413 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX4P78413 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX4P78413 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX4P78413 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX4P78413 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX4P78413 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX4P78413 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX4P78413 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX4P78413 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX4P78413 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX4P78413 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX4P78413 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms