Protein–RNA interactions for Protein: P62979

RPS27A, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP62979 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27AP62979 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS27AP62979 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS27AP62979 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 389.8 ms