Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2NP61088 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2NP61088 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2NP61088 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2NP61088 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NP61088 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms