Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERVFC1P60507 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVFC1P60507 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVFC1P60507 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERVFC1P60507 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVFC1P60507 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVFC1P60507 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ERVFC1P60507 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms