Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP10-9P60411 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRTAP10-9P60411 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP10-9P60411 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP10-9P60411 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP10-9P60411 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms