Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA1P56199 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA1P56199 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA1P56199 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA1P56199 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA1P56199 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms