Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTEP56180 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTEP56180 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTEP56180 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTEP56180 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTEP56180 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTEP56180 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTEP56180 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTEP56180 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTEP56180 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTEP56180 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTEP56180 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTEP56180 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTEP56180 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTEP56180 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTEP56180 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTEP56180 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTEP56180 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTEP56180 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTEP56180 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTEP56180 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTEP56180 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTEP56180 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTEP56180 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTEP56180 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTEP56180 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTEP56180 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTEP56180 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTEP56180 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTEP56180 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTEP56180 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTEP56180 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTEP56180 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTEP56180 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTEP56180 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TPTEP56180 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPTEP56180 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPTEP56180 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPTEP56180 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPTEP56180 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPTEP56180 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPTEP56180 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPTEP56180 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPTEP56180 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPTEP56180 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPTEP56180 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPTEP56180 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPTEP56180 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPTEP56180 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPTEP56180 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPTEP56180 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPTEP56180 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TPTEP56180 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPTEP56180 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPTEP56180 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPTEP56180 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPTEP56180 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPTEP56180 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPTEP56180 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TPTEP56180 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPTEP56180 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPTEP56180 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPTEP56180 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPTEP56180 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPTEP56180 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPTEP56180 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPTEP56180 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPTEP56180 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPTEP56180 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPTEP56180 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPTEP56180 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPTEP56180 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPTEP56180 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPTEP56180 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPTEP56180 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPTEP56180 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TPTEP56180 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPTEP56180 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPTEP56180 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPTEP56180 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPTEP56180 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPTEP56180 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPTEP56180 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPTEP56180 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPTEP56180 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPTEP56180 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPTEP56180 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPTEP56180 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPTEP56180 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPTEP56180 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPTEP56180 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPTEP56180 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPTEP56180 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPTEP56180 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPTEP56180 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTEP56180 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTEP56180 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTEP56180 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTEP56180 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTEP56180 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms