Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3BP55884 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
EIF3BP55884 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EIF3BP55884 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF3BP55884 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms