Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPD52P55327 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPD52P55327 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPD52P55327 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPD52P55327 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPD52P55327 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPD52P55327 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPD52P55327 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPD52P55327 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPD52P55327 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPD52P55327 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPD52P55327 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPD52P55327 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TPD52P55327 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52P55327 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52P55327 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52P55327 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52P55327 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52P55327 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52P55327 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52P55327 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52P55327 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52P55327 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52P55327 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52P55327 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPD52P55327 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52P55327 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52P55327 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52P55327 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52P55327 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52P55327 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52P55327 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52P55327 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPD52P55327 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPD52P55327 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPD52P55327 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPD52P55327 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPD52P55327 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPD52P55327 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPD52P55327 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPD52P55327 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPD52P55327 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPD52P55327 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPD52P55327 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPD52P55327 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPD52P55327 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPD52P55327 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPD52P55327 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPD52P55327 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPD52P55327 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TPD52P55327 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPD52P55327 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPD52P55327 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPD52P55327 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPD52P55327 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPD52P55327 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPD52P55327 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPD52P55327 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPD52P55327 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52P55327 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52P55327 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52P55327 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52P55327 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52P55327 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPD52P55327 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPD52P55327 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPD52P55327 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPD52P55327 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPD52P55327 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPD52P55327 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPD52P55327 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPD52P55327 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPD52P55327 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPD52P55327 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPD52P55327 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPD52P55327 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPD52P55327 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPD52P55327 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPD52P55327 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPD52P55327 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPD52P55327 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPD52P55327 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPD52P55327 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPD52P55327 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TPD52P55327 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TPD52P55327 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPD52P55327 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPD52P55327 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPD52P55327 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPD52P55327 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TPD52P55327 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPD52P55327 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPD52P55327 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPD52P55327 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPD52P55327 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPD52P55327 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPD52P55327 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPD52P55327 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPD52P55327 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPD52P55327 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms