Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH13P55290 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH13P55290 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH13P55290 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH13P55290 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH13P55290 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH13P55290 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH13P55290 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH13P55290 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH13P55290 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH13P55290 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH13P55290 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH13P55290 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH13P55290 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH13P55290 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH13P55290 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH13P55290 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH13P55290 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH13P55290 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH13P55290 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH13P55290 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH13P55290 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH13P55290 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH13P55290 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH13P55290 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH13P55290 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH13P55290 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH13P55290 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH13P55290 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH13P55290 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH13P55290 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH13P55290 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH13P55290 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH13P55290 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH13P55290 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH13P55290 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH13P55290 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH13P55290 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH13P55290 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDH13P55290 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH13P55290 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH13P55290 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH13P55290 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH13P55290 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH13P55290 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH13P55290 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH13P55290 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH13P55290 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH13P55290 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH13P55290 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH13P55290 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH13P55290 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH13P55290 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH13P55290 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH13P55290 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH13P55290 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH13P55290 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH13P55290 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH13P55290 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH13P55290 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH13P55290 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH13P55290 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH13P55290 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH13P55290 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH13P55290 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH13P55290 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH13P55290 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH13P55290 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH13P55290 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH13P55290 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH13P55290 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH13P55290 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH13P55290 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH13P55290 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH13P55290 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH13P55290 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH13P55290 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH13P55290 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH13P55290 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH13P55290 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH13P55290 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH13P55290 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH13P55290 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH13P55290 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH13P55290 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH13P55290 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH13P55290 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH13P55290 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH13P55290 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH13P55290 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH13P55290 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH13P55290 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH13P55290 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH13P55290 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH13P55290 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH13P55290 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH13P55290 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH13P55290 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH13P55290 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH13P55290 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms