Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms