Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPHB4P54760 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EPHB4P54760 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EPHB4P54760 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EPHB4P54760 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EPHB4P54760 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EPHB4P54760 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EPHB4P54760 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPHB4P54760 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EPHB4P54760 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EPHB4P54760 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPHB4P54760 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPHB4P54760 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EPHB4P54760 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPHB4P54760 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPHB4P54760 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPHB4P54760 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPHB4P54760 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPHB4P54760 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPHB4P54760 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPHB4P54760 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPHB4P54760 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPHB4P54760 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPHB4P54760 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPHB4P54760 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPHB4P54760 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms