Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD23BP54727 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD23BP54727 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD23BP54727 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD23BP54727 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD23BP54727 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD23BP54727 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD23BP54727 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD23BP54727 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD23BP54727 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD23BP54727 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RAD23BP54727 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD23BP54727 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD23BP54727 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD23BP54727 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD23BP54727 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD23BP54727 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD23BP54727 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD23BP54727 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD23BP54727 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD23BP54727 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD23BP54727 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAD23BP54727 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD23BP54727 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD23BP54727 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD23BP54727 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD23BP54727 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD23BP54727 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD23BP54727 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD23BP54727 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD23BP54727 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD23BP54727 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD23BP54727 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms