Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HIRAP54198 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HIRAP54198 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HIRAP54198 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HIRAP54198 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HIRAP54198 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRAP54198 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRAP54198 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRAP54198 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRAP54198 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRAP54198 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRAP54198 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
HIRAP54198 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HIRAP54198 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HIRAP54198 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
HIRAP54198 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
HIRAP54198 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
HIRAP54198 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HIRAP54198 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
HIRAP54198 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRAP54198 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRAP54198 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRAP54198 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRAP54198 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRAP54198 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRAP54198 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRAP54198 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRAP54198 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRAP54198 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
HIRAP54198 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HIRAP54198 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HIRAP54198 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
HIRAP54198 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRAP54198 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HIRAP54198 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HIRAP54198 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRAP54198 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRAP54198 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIRAP54198 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
HIRAP54198 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRAP54198 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRAP54198 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRAP54198 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRAP54198 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRAP54198 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRAP54198 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRAP54198 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRAP54198 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRAP54198 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HIRAP54198 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HIRAP54198 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
HIRAP54198 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HIRAP54198 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HIRAP54198 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRAP54198 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRAP54198 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRAP54198 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRAP54198 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRAP54198 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRAP54198 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRAP54198 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRAP54198 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRAP54198 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRAP54198 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRAP54198 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRAP54198 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRAP54198 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRAP54198 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRAP54198 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRAP54198 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRAP54198 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRAP54198 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRAP54198 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRAP54198 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRAP54198 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRAP54198 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRAP54198 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRAP54198 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HIRAP54198 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HIRAP54198 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRAP54198 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRAP54198 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRAP54198 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRAP54198 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRAP54198 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRAP54198 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HIRAP54198 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
HIRAP54198 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRAP54198 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRAP54198 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRAP54198 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRAP54198 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRAP54198 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HIRAP54198 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HIRAP54198 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRAP54198 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRAP54198 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRAP54198 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HIRAP54198 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HIRAP54198 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms