Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BLMP54132 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
BLMP54132 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
BLMP54132 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
BLMP54132 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
BLMP54132 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
BLMP54132 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
BLMP54132 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
BLMP54132 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BLMP54132 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
BLMP54132 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
BLMP54132 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BLMP54132 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BLMP54132 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BLMP54132 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BLMP54132 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BLMP54132 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BLMP54132 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BLMP54132 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BLMP54132 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BLMP54132 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BLMP54132 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
BLMP54132 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BLMP54132 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BLMP54132 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BLMP54132 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BLMP54132 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BLMP54132 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BLMP54132 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BLMP54132 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
BLMP54132 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
BLMP54132 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
BLMP54132 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BLMP54132 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BLMP54132 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BLMP54132 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
BLMP54132 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
BLMP54132 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
BLMP54132 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
BLMP54132 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
BLMP54132 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BLMP54132 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BLMP54132 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
BLMP54132 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BLMP54132 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BLMP54132 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BLMP54132 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BLMP54132 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
BLMP54132 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
BLMP54132 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
BLMP54132 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
BLMP54132 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
BLMP54132 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
BLMP54132 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BLMP54132 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BLMP54132 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BLMP54132 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BLMP54132 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BLMP54132 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
BLMP54132 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BLMP54132 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BLMP54132 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BLMP54132 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BLMP54132 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BLMP54132 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
BLMP54132 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
BLMP54132 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
BLMP54132 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
BLMP54132 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
BLMP54132 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BLMP54132 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BLMP54132 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BLMP54132 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BLMP54132 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BLMP54132 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BLMP54132 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BLMP54132 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BLMP54132 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BLMP54132 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BLMP54132 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BLMP54132 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
BLMP54132 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BLMP54132 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
BLMP54132 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
BLMP54132 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
BLMP54132 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
BLMP54132 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
BLMP54132 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BLMP54132 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BLMP54132 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BLMP54132 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
BLMP54132 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
BLMP54132 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
BLMP54132 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
BLMP54132 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
BLMP54132 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BLMP54132 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BLMP54132 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BLMP54132 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BLMP54132 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms