Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPAP53621 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPAP53621 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPAP53621 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COPAP53621 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPAP53621 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPAP53621 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPAP53621 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPAP53621 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPAP53621 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPAP53621 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPAP53621 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPAP53621 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
COPAP53621 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
COPAP53621 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPAP53621 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COPAP53621 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COPAP53621 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPAP53621 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPAP53621 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPAP53621 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPAP53621 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPAP53621 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPAP53621 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
COPAP53621 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPAP53621 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPAP53621 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPAP53621 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPAP53621 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPAP53621 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPAP53621 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPAP53621 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPAP53621 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPAP53621 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPAP53621 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPAP53621 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPAP53621 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPAP53621 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPAP53621 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COPAP53621 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPAP53621 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPAP53621 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPAP53621 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPAP53621 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPAP53621 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPAP53621 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPAP53621 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPAP53621 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPAP53621 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPAP53621 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPAP53621 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPAP53621 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPAP53621 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPAP53621 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPAP53621 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPAP53621 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPAP53621 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPAP53621 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPAP53621 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COPAP53621 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPAP53621 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPAP53621 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPAP53621 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
COPAP53621 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPAP53621 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPAP53621 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPAP53621 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPAP53621 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPAP53621 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPAP53621 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPAP53621 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPAP53621 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPAP53621 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPAP53621 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPAP53621 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPAP53621 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPAP53621 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPAP53621 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPAP53621 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPAP53621 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPAP53621 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPAP53621 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPAP53621 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPAP53621 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPAP53621 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPAP53621 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COPAP53621 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms