Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A1P53007 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC25A1P53007 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms