Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
THOP1P52888 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
THOP1P52888 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
THOP1P52888 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
THOP1P52888 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
THOP1P52888 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THOP1P52888 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THOP1P52888 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THOP1P52888 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THOP1P52888 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THOP1P52888 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THOP1P52888 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THOP1P52888 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THOP1P52888 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THOP1P52888 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THOP1P52888 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THOP1P52888 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THOP1P52888 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THOP1P52888 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THOP1P52888 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THOP1P52888 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THOP1P52888 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THOP1P52888 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THOP1P52888 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THOP1P52888 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THOP1P52888 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THOP1P52888 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THOP1P52888 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THOP1P52888 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THOP1P52888 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THOP1P52888 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THOP1P52888 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THOP1P52888 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
THOP1P52888 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
THOP1P52888 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
THOP1P52888 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THOP1P52888 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THOP1P52888 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THOP1P52888 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THOP1P52888 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THOP1P52888 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THOP1P52888 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THOP1P52888 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THOP1P52888 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THOP1P52888 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THOP1P52888 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
THOP1P52888 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
THOP1P52888 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
THOP1P52888 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
THOP1P52888 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
THOP1P52888 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
THOP1P52888 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
THOP1P52888 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
THOP1P52888 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THOP1P52888 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THOP1P52888 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THOP1P52888 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THOP1P52888 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THOP1P52888 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THOP1P52888 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
THOP1P52888 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THOP1P52888 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THOP1P52888 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THOP1P52888 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THOP1P52888 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THOP1P52888 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THOP1P52888 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THOP1P52888 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THOP1P52888 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
THOP1P52888 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
THOP1P52888 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THOP1P52888 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
THOP1P52888 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
THOP1P52888 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
THOP1P52888 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THOP1P52888 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THOP1P52888 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THOP1P52888 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
THOP1P52888 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THOP1P52888 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THOP1P52888 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THOP1P52888 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THOP1P52888 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THOP1P52888 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THOP1P52888 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THOP1P52888 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THOP1P52888 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THOP1P52888 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THOP1P52888 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THOP1P52888 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
THOP1P52888 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THOP1P52888 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THOP1P52888 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THOP1P52888 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THOP1P52888 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THOP1P52888 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THOP1P52888 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THOP1P52888 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THOP1P52888 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THOP1P52888 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms