Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA3P51805 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA3P51805 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA3P51805 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA3P51805 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA3P51805 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNA3P51805 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNA3P51805 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNA3P51805 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNA3P51805 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNA3P51805 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLXNA3P51805 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNA3P51805 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA3P51805 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNA3P51805 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNA3P51805 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA3P51805 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA3P51805 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNA3P51805 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA3P51805 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNA3P51805 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA3P51805 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA3P51805 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA3P51805 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA3P51805 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNA3P51805 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNA3P51805 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNA3P51805 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNA3P51805 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNA3P51805 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNA3P51805 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNA3P51805 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms