Protein–RNA interactions for Protein: P51684

CCR6, C-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6P51684 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR6P51684 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR6P51684 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR6P51684 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR6P51684 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR6P51684 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR6P51684 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR6P51684 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR6P51684 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR6P51684 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR6P51684 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR6P51684 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR6P51684 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR6P51684 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR6P51684 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR6P51684 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR6P51684 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR6P51684 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR6P51684 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR6P51684 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR6P51684 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR6P51684 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR6P51684 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR6P51684 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR6P51684 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR6P51684 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR6P51684 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR6P51684 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR6P51684 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR6P51684 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR6P51684 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR6P51684 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR6P51684 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR6P51684 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR6P51684 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR6P51684 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR6P51684 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR6P51684 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR6P51684 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR6P51684 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR6P51684 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR6P51684 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR6P51684 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR6P51684 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR6P51684 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR6P51684 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR6P51684 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR6P51684 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCR6P51684 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR6P51684 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR6P51684 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR6P51684 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR6P51684 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR6P51684 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR6P51684 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR6P51684 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR6P51684 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR6P51684 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR6P51684 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR6P51684 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR6P51684 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR6P51684 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR6P51684 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR6P51684 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR6P51684 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR6P51684 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR6P51684 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR6P51684 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR6P51684 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR6P51684 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR6P51684 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR6P51684 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR6P51684 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR6P51684 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR6P51684 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR6P51684 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR6P51684 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR6P51684 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR6P51684 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR6P51684 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR6P51684 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR6P51684 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR6P51684 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR6P51684 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR6P51684 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR6P51684 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR6P51684 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR6P51684 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR6P51684 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR6P51684 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR6P51684 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR6P51684 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCR6P51684 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR6P51684 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR6P51684 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR6P51684 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR6P51684 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR6P51684 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR6P51684 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR6P51684 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms