Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBE2D1P51668 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2D1P51668 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2D1P51668 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms