Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB27AP51159 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB27AP51159 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB27AP51159 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB27AP51159 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB27AP51159 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB27AP51159 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB27AP51159 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB27AP51159 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB27AP51159 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB27AP51159 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB27AP51159 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB27AP51159 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB27AP51159 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB27AP51159 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB27AP51159 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB27AP51159 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms