Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK9P50750 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK9P50750 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK9P50750 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK9P50750 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK9P50750 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK9P50750 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK9P50750 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK9P50750 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK9P50750 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK9P50750 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK9P50750 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK9P50750 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK9P50750 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK9P50750 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK9P50750 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK9P50750 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK9P50750 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK9P50750 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK9P50750 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK9P50750 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK9P50750 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK9P50750 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK9P50750 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK9P50750 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK9P50750 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK9P50750 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK9P50750 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK9P50750 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK9P50750 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK9P50750 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK9P50750 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK9P50750 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK9P50750 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK9P50750 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK9P50750 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK9P50750 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK9P50750 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK9P50750 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK9P50750 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK9P50750 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK9P50750 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK9P50750 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK9P50750 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK9P50750 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK9P50750 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK9P50750 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK9P50750 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK9P50750 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK9P50750 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK9P50750 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK9P50750 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK9P50750 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK9P50750 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK9P50750 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK9P50750 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK9P50750 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK9P50750 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK9P50750 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK9P50750 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK9P50750 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK9P50750 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK9P50750 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK9P50750 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK9P50750 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK9P50750 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK9P50750 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK9P50750 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK9P50750 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK9P50750 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK9P50750 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK9P50750 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK9P50750 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK9P50750 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK9P50750 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK9P50750 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK9P50750 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK9P50750 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK9P50750 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK9P50750 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK9P50750 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK9P50750 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK9P50750 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK9P50750 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK9P50750 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK9P50750 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK9P50750 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK9P50750 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK9P50750 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK9P50750 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK9P50750 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK9P50750 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK9P50750 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK9P50750 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK9P50750 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK9P50750 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK9P50750 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK9P50750 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK9P50750 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK9P50750 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms