Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFCP49767 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFCP49767 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFCP49767 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFCP49767 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFCP49767 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms