Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNTAP49354 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNTAP49354 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNTAP49354 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNTAP49354 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNTAP49354 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNTAP49354 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNTAP49354 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNTAP49354 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNTAP49354 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNTAP49354 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNTAP49354 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FNTAP49354 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FNTAP49354 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FNTAP49354 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FNTAP49354 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FNTAP49354 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FNTAP49354 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FNTAP49354 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FNTAP49354 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FNTAP49354 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FNTAP49354 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FNTAP49354 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FNTAP49354 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FNTAP49354 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNTAP49354 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNTAP49354 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNTAP49354 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNTAP49354 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNTAP49354 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNTAP49354 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNTAP49354 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNTAP49354 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNTAP49354 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNTAP49354 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNTAP49354 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNTAP49354 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNTAP49354 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNTAP49354 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FNTAP49354 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FNTAP49354 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FNTAP49354 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FNTAP49354 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FNTAP49354 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FNTAP49354 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FNTAP49354 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FNTAP49354 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FNTAP49354 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FNTAP49354 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FNTAP49354 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FNTAP49354 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNTAP49354 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FNTAP49354 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNTAP49354 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FNTAP49354 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FNTAP49354 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FNTAP49354 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FNTAP49354 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FNTAP49354 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FNTAP49354 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FNTAP49354 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FNTAP49354 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNTAP49354 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNTAP49354 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNTAP49354 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNTAP49354 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNTAP49354 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNTAP49354 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNTAP49354 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNTAP49354 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNTAP49354 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FNTAP49354 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FNTAP49354 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FNTAP49354 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FNTAP49354 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FNTAP49354 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FNTAP49354 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FNTAP49354 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FNTAP49354 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FNTAP49354 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FNTAP49354 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FNTAP49354 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FNTAP49354 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FNTAP49354 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FNTAP49354 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FNTAP49354 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FNTAP49354 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FNTAP49354 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FNTAP49354 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FNTAP49354 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FNTAP49354 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNTAP49354 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNTAP49354 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNTAP49354 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNTAP49354 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNTAP49354 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNTAP49354 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNTAP49354 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTAP49354 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTAP49354 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms