Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TNNI2P48788 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNNI2P48788 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNNI2P48788 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNNI2P48788 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNNI2P48788 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TNNI2P48788 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNNI2P48788 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNNI2P48788 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNNI2P48788 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNNI2P48788 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNNI2P48788 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNNI2P48788 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNNI2P48788 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNNI2P48788 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNNI2P48788 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TNNI2P48788 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms