Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RXRGP48443 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RXRGP48443 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RXRGP48443 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RXRGP48443 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRGP48443 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRGP48443 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRGP48443 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRGP48443 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRGP48443 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRGP48443 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRGP48443 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRGP48443 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRGP48443 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRGP48443 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRGP48443 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RXRGP48443 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RXRGP48443 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RXRGP48443 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRGP48443 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRGP48443 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRGP48443 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRGP48443 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRGP48443 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRGP48443 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRGP48443 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRGP48443 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRGP48443 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRGP48443 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRGP48443 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRGP48443 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRGP48443 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRGP48443 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRGP48443 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRGP48443 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRGP48443 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRGP48443 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRGP48443 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRGP48443 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRGP48443 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRGP48443 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRGP48443 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RXRGP48443 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRGP48443 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRGP48443 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRGP48443 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RXRGP48443 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRGP48443 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRGP48443 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RXRGP48443 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRGP48443 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RXRGP48443 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RXRGP48443 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RXRGP48443 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RXRGP48443 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RXRGP48443 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RXRGP48443 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRGP48443 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRGP48443 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RXRGP48443 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRGP48443 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRGP48443 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RXRGP48443 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRGP48443 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RXRGP48443 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RXRGP48443 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RXRGP48443 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RXRGP48443 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRGP48443 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRGP48443 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRGP48443 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RXRGP48443 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RXRGP48443 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RXRGP48443 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RXRGP48443 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RXRGP48443 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRGP48443 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RXRGP48443 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RXRGP48443 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRGP48443 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRGP48443 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RXRGP48443 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRGP48443 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRGP48443 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRGP48443 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RXRGP48443 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms