Protein–RNA interactions for Protein: P48029

SLC6A8, Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8P48029 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A8P48029 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A8P48029 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A8P48029 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A8P48029 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms