Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms