Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPDA1P46926 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GNPDA1P46926 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPDA1P46926 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNPDA1P46926 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms