Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSMC4P43686 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSMC4P43686 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSMC4P43686 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSMC4P43686 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PSMC4P43686 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSMC4P43686 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMC4P43686 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PSMC4P43686 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMC4P43686 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMC4P43686 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMC4P43686 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMC4P43686 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms