Protein–RNA interactions for Protein: P41968

MC3R, Melanocortin receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC3RP41968 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MC3RP41968 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MC3RP41968 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MC3RP41968 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MC3RP41968 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MC3RP41968 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MC3RP41968 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MC3RP41968 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MC3RP41968 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MC3RP41968 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MC3RP41968 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MC3RP41968 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MC3RP41968 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MC3RP41968 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MC3RP41968 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MC3RP41968 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MC3RP41968 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MC3RP41968 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MC3RP41968 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MC3RP41968 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MC3RP41968 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MC3RP41968 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MC3RP41968 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MC3RP41968 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MC3RP41968 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MC3RP41968 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MC3RP41968 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MC3RP41968 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MC3RP41968 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MC3RP41968 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MC3RP41968 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MC3RP41968 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MC3RP41968 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MC3RP41968 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MC3RP41968 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC3RP41968 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC3RP41968 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC3RP41968 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MC3RP41968 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MC3RP41968 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MC3RP41968 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MC3RP41968 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MC3RP41968 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MC3RP41968 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MC3RP41968 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MC3RP41968 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MC3RP41968 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MC3RP41968 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MC3RP41968 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MC3RP41968 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MC3RP41968 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MC3RP41968 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MC3RP41968 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MC3RP41968 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MC3RP41968 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MC3RP41968 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MC3RP41968 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MC3RP41968 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MC3RP41968 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MC3RP41968 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MC3RP41968 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MC3RP41968 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MC3RP41968 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MC3RP41968 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MC3RP41968 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MC3RP41968 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MC3RP41968 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MC3RP41968 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MC3RP41968 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MC3RP41968 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MC3RP41968 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MC3RP41968 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MC3RP41968 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MC3RP41968 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MC3RP41968 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MC3RP41968 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MC3RP41968 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MC3RP41968 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MC3RP41968 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MC3RP41968 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MC3RP41968 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MC3RP41968 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MC3RP41968 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MC3RP41968 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MC3RP41968 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MC3RP41968 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MC3RP41968 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MC3RP41968 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MC3RP41968 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MC3RP41968 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MC3RP41968 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MC3RP41968 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MC3RP41968 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MC3RP41968 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MC3RP41968 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MC3RP41968 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MC3RP41968 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MC3RP41968 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MC3RP41968 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MC3RP41968 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms