Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBL1P41271 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NBL1P41271 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBL1P41271 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBL1P41271 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBL1P41271 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBL1P41271 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBL1P41271 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBL1P41271 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBL1P41271 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBL1P41271 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBL1P41271 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBL1P41271 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBL1P41271 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBL1P41271 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBL1P41271 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBL1P41271 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBL1P41271 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBL1P41271 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBL1P41271 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBL1P41271 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBL1P41271 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBL1P41271 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBL1P41271 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NBL1P41271 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBL1P41271 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBL1P41271 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NBL1P41271 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBL1P41271 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBL1P41271 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NBL1P41271 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NBL1P41271 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NBL1P41271 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NBL1P41271 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NBL1P41271 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NBL1P41271 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBL1P41271 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBL1P41271 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBL1P41271 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBL1P41271 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBL1P41271 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBL1P41271 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBL1P41271 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBL1P41271 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NBL1P41271 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBL1P41271 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBL1P41271 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBL1P41271 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBL1P41271 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBL1P41271 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBL1P41271 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBL1P41271 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBL1P41271 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBL1P41271 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBL1P41271 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBL1P41271 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBL1P41271 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBL1P41271 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBL1P41271 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBL1P41271 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBL1P41271 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBL1P41271 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NBL1P41271 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBL1P41271 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBL1P41271 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBL1P41271 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NBL1P41271 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NBL1P41271 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBL1P41271 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBL1P41271 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBL1P41271 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBL1P41271 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBL1P41271 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBL1P41271 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBL1P41271 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBL1P41271 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBL1P41271 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBL1P41271 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBL1P41271 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBL1P41271 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBL1P41271 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBL1P41271 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBL1P41271 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBL1P41271 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBL1P41271 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBL1P41271 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBL1P41271 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBL1P41271 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBL1P41271 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBL1P41271 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBL1P41271 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NBL1P41271 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NBL1P41271 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBL1P41271 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBL1P41271 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBL1P41271 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBL1P41271 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBL1P41271 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBL1P41271 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBL1P41271 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms