Protein–RNA interactions for Protein: P40967

PMEL, Melanocyte protein PMEL, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMELP40967 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMELP40967 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMELP40967 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMELP40967 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMELP40967 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMELP40967 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMELP40967 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMELP40967 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMELP40967 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMELP40967 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMELP40967 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMELP40967 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMELP40967 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMELP40967 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMELP40967 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMELP40967 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMELP40967 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMELP40967 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PMELP40967 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMELP40967 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMELP40967 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMELP40967 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMELP40967 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMELP40967 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMELP40967 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMELP40967 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PMELP40967 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMELP40967 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMELP40967 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PMELP40967 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMELP40967 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMELP40967 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMELP40967 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMELP40967 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMELP40967 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMELP40967 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMELP40967 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMELP40967 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMELP40967 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMELP40967 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMELP40967 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMELP40967 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMELP40967 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMELP40967 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMELP40967 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMELP40967 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMELP40967 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMELP40967 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMELP40967 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMELP40967 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMELP40967 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMELP40967 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMELP40967 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMELP40967 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PMELP40967 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMELP40967 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMELP40967 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMELP40967 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMELP40967 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMELP40967 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMELP40967 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMELP40967 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMELP40967 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMELP40967 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMELP40967 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMELP40967 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMELP40967 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMELP40967 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMELP40967 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMELP40967 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMELP40967 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMELP40967 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMELP40967 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMELP40967 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMELP40967 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMELP40967 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMELP40967 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMELP40967 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMELP40967 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMELP40967 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMELP40967 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMELP40967 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMELP40967 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMELP40967 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMELP40967 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMELP40967 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMELP40967 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMELP40967 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMELP40967 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PMELP40967 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMELP40967 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PMELP40967 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PMELP40967 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PMELP40967 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMELP40967 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMELP40967 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMELP40967 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMELP40967 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMELP40967 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMELP40967 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms