Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTRLP40313 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTRLP40313 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTRLP40313 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTRLP40313 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTRLP40313 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTRLP40313 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTRLP40313 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTRLP40313 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTRLP40313 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTRLP40313 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTRLP40313 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTRLP40313 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTRLP40313 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTRLP40313 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTRLP40313 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTRLP40313 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTRLP40313 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTRLP40313 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTRLP40313 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTRLP40313 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTRLP40313 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTRLP40313 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTRLP40313 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTRLP40313 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTRLP40313 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTRLP40313 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTRLP40313 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTRLP40313 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTRLP40313 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTRLP40313 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTRLP40313 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTRLP40313 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTRLP40313 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTRLP40313 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTRLP40313 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTRLP40313 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTRLP40313 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTRLP40313 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTRLP40313 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTRLP40313 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTRLP40313 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTRLP40313 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTRLP40313 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTRLP40313 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTRLP40313 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTRLP40313 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTRLP40313 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTRLP40313 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTRLP40313 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTRLP40313 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTRLP40313 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTRLP40313 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTRLP40313 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTRLP40313 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTRLP40313 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTRLP40313 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTRLP40313 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTRLP40313 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTRLP40313 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTRLP40313 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTRLP40313 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTRLP40313 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTRLP40313 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTRLP40313 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTRLP40313 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTRLP40313 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTRLP40313 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTRLP40313 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTRLP40313 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTRLP40313 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTRLP40313 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTRLP40313 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTRLP40313 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTRLP40313 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTRLP40313 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTRLP40313 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTRLP40313 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTRLP40313 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTRLP40313 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTRLP40313 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTRLP40313 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTRLP40313 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTRLP40313 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTRLP40313 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTRLP40313 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTRLP40313 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTRLP40313 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTRLP40313 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTRLP40313 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTRLP40313 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTRLP40313 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTRLP40313 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTRLP40313 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTRLP40313 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTRLP40313 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTRLP40313 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTRLP40313 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTRLP40313 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTRLP40313 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms