Protein–RNA interactions for Protein: P40227

CCT6A, T-complex protein 1 subunit zeta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT6AP40227 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCT6AP40227 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCT6AP40227 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCT6AP40227 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCT6AP40227 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCT6AP40227 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCT6AP40227 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCT6AP40227 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCT6AP40227 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCT6AP40227 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCT6AP40227 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCT6AP40227 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCT6AP40227 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCT6AP40227 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCT6AP40227 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCT6AP40227 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCT6AP40227 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCT6AP40227 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCT6AP40227 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCT6AP40227 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCT6AP40227 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCT6AP40227 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCT6AP40227 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCT6AP40227 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCT6AP40227 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCT6AP40227 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCT6AP40227 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCT6AP40227 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms