Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 GGA2YHR108W 1758 nt7.82□□□□□ -1.16
DDI1P40087 MET1YKR069W 1782 nt7.82□□□□□ -1.16
DDI1P40087 TVP23YDR084C 600 nt7.8□□□□□ -1.16
DDI1P40087 MRS4YKR052C 915 nt7.8□□□□□ -1.16
DDI1P40087 KGD2YDR148C 1392 nt7.8□□□□□ -1.16
DDI1P40087 YMR210WYMR210W 1350 nt7.8□□□□□ -1.16
DDI1P40087 GCD11YER025W 1584 nt7.8□□□□□ -1.16
DDI1P40087 PMA2YPL036W 2844 nt7.79□□□□□ -1.16
DDI1P40087 RIB2YOL066C 1776 nt7.79□□□□□ -1.16
DDI1P40087 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.79□□□□□ -1.16
DDI1P40087 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.79□□□□□ -1.16
DDI1P40087 SWT21YNL187W 1074 nt7.79□□□□□ -1.16
DDI1P40087 THI3YDL080C 1830 nt7.78□□□□□ -1.16
DDI1P40087 FRT1YOR324C 1809 nt7.78□□□□□ -1.16
DDI1P40087 FTH1YBR207W 1398 nt7.78□□□□□ -1.16
DDI1P40087 ECM10YEL030W 1935 nt7.78□□□□□ -1.16
DDI1P40087 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.77□□□□□ -1.17
DDI1P40087 RSC4YKR008W 1878 nt7.75□□□□□ -1.17
DDI1P40087 SBP1YHL034C 885 nt7.75□□□□□ -1.17
DDI1P40087 ESS1YJR017C 513 nt7.75□□□□□ -1.17
DDI1P40087 YKL053WYKL053W 375 nt7.75□□□□□ -1.17
DDI1P40087 ENO2YHR174W 1314 nt7.75□□□□□ -1.17
DDI1P40087 YPI1YFR003C 468 nt7.74□□□□□ -1.17
DDI1P40087 AIM34YMR003W 597 nt7.74□□□□□ -1.17
DDI1P40087 DIA4YHR011W 1341 nt7.74□□□□□ -1.17
DDI1P40087 MAS1YLR163C 1389 nt7.73□□□□□ -1.17
DDI1P40087 PFS2YNL317W 1398 nt7.72□□□□□ -1.17
DDI1P40087 SPS100YHR139C 981 nt7.72□□□□□ -1.17
DDI1P40087 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.72□□□□□ -1.17
DDI1P40087 LEA1YPL213W 717 nt7.72□□□□□ -1.17
DDI1P40087 AMF1YOR378W 1548 nt7.72□□□□□ -1.17
DDI1P40087 NDE1YMR145C 1683 nt7.71□□□□□ -1.18
DDI1P40087 MCM5YLR274W 2328 nt7.71□□□□□ -1.18
DDI1P40087 GGC1YDL198C 903 nt7.7□□□□□ -1.18
DDI1P40087 YLR072WYLR072W 2082 nt7.7□□□□□ -1.18
DDI1P40087 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.7□□□□□ -1.18
DDI1P40087 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.7□□□□□ -1.18
DDI1P40087 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.7□□□□□ -1.18
DDI1P40087 snR86snR86 1004 nt7.69□□□□□ -1.18
DDI1P40087 ABZ2YMR289W 1125 nt7.69□□□□□ -1.18
DDI1P40087 MDH2YOL126C 1134 nt7.68□□□□□ -1.18
DDI1P40087 IML3YBR107C 738 nt7.68□□□□□ -1.18
DDI1P40087 HSV2YGR223C 1347 nt7.68□□□□□ -1.18
DDI1P40087 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.67□□□□□ -1.18
DDI1P40087 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.67□□□□□ -1.18
DDI1P40087 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.67□□□□□ -1.18
DDI1P40087 SAN1YDR143C 1833 nt7.66□□□□□ -1.18
DDI1P40087 TOP3YLR234W 1971 nt7.66□□□□□ -1.18
DDI1P40087 CTF3YLR381W 2202 nt7.66□□□□□ -1.18
DDI1P40087 BEM1YBR200W 1656 nt7.66□□□□□ -1.18
DDI1P40087 ITR1YDR497C 1755 nt7.66□□□□□ -1.18
DDI1P40087 SNZ1YMR096W 894 nt7.65□□□□□ -1.18
DDI1P40087 YPR126CYPR126C 309 nt7.65□□□□□ -1.18
DDI1P40087 AAC3YBR085W 924 nt7.65□□□□□ -1.18
DDI1P40087 SLM3YDL033C 1254 nt7.63□□□□□ -1.19
DDI1P40087 YJL009WYJL009W 327 nt7.63□□□□□ -1.19
DDI1P40087 HIS3YOR202W 663 nt7.63□□□□□ -1.19
DDI1P40087 CHA1YCL064C 1083 nt7.62□□□□□ -1.19
DDI1P40087 SRP54YPR088C 1626 nt7.62□□□□□ -1.19
DDI1P40087 AFG2YLR397C 2343 nt7.62□□□□□ -1.19
DDI1P40087 GAS1YMR307W 1680 nt7.61□□□□□ -1.19
DDI1P40087 TPC1YGR096W 945 nt7.61□□□□□ -1.19
DDI1P40087 YNR029CYNR029C 1290 nt7.61□□□□□ -1.19
DDI1P40087 LEU2YCL018W 1095 nt7.61□□□□□ -1.19
DDI1P40087 CTI6YPL181W 1521 nt7.61□□□□□ -1.19
DDI1P40087 ABP1YCR088W 1779 nt7.61□□□□□ -1.19
DDI1P40087 PRC1YMR297W 1599 nt7.6□□□□□ -1.19
DDI1P40087 TMS1YDR105C 1422 nt7.6□□□□□ -1.19
DDI1P40087 PTC6YCR079W 1329 nt7.59□□□□□ -1.19
DDI1P40087 LYS20YDL182W 1287 nt7.59□□□□□ -1.19
DDI1P40087 CCR4YAL021C 2514 nt7.58□□□□□ -1.2
DDI1P40087 NDE2YDL085W 1638 nt7.57□□□□□ -1.2
DDI1P40087 YIL108WYIL108W 2091 nt7.57□□□□□ -1.2
DDI1P40087 ATP10YLR393W 840 nt7.57□□□□□ -1.2
DDI1P40087 NAM8YHR086W 1572 nt7.56□□□□□ -1.2
DDI1P40087 PAR32YDL173W 888 nt7.56□□□□□ -1.2
DDI1P40087 YNL140CYNL140C 570 nt7.56□□□□□ -1.2
DDI1P40087 MAM3YOL060C 2121 nt7.55□□□□□ -1.2
DDI1P40087 TIF3YPR163C 1311 nt7.54□□□□□ -1.2
DDI1P40087 CCT5YJR064W 1689 nt7.54□□□□□ -1.2
DDI1P40087 YPL264CYPL264C 1062 nt7.54□□□□□ -1.2
DDI1P40087 PMT7YDR307W 1989 nt7.53□□□□□ -1.2
DDI1P40087 YJR149WYJR149W 1215 nt7.52□□□□□ -1.21
DDI1P40087 ADH1YOL086C 1047 nt7.52□□□□□ -1.21
DDI1P40087 ADE2YOR128C 1716 nt7.52□□□□□ -1.21
DDI1P40087 MEP1YGR121C 1479 nt7.51□□□□□ -1.21
DDI1P40087 REX2YLR059C 810 nt7.51□□□□□ -1.21
DDI1P40087 YPT11YNL304W 1254 nt7.51□□□□□ -1.21
DDI1P40087 ATO2YNR002C 849 nt7.51□□□□□ -1.21
DDI1P40087 INO1YJL153C 1602 nt7.51□□□□□ -1.21
DDI1P40087 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.5□□□□□ -1.21
DDI1P40087 SPE4YLR146C 903 nt7.49□□□□□ -1.21
DDI1P40087 MHF1YOL086W-A 273 nt7.49□□□□□ -1.21
DDI1P40087 INM1YHR046C 888 nt7.48□□□□□ -1.21
DDI1P40087 ERG6YML008C 1152 nt7.48□□□□□ -1.21
DDI1P40087 YMR253CYMR253C 1245 nt7.48□□□□□ -1.21
DDI1P40087 YBR056WYBR056W 1506 nt7.47□□□□□ -1.21
DDI1P40087 YIR035CYIR035C 765 nt7.47□□□□□ -1.21
DDI1P40087 BUB2YMR055C 921 nt7.47□□□□□ -1.21
DDI1P40087 ERR3YMR323W 1314 nt7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.8 ms