Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FEN1P39748 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FEN1P39748 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FEN1P39748 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FEN1P39748 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FEN1P39748 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FEN1P39748 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FEN1P39748 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FEN1P39748 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FEN1P39748 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FEN1P39748 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FEN1P39748 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FEN1P39748 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FEN1P39748 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FEN1P39748 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FEN1P39748 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FEN1P39748 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FEN1P39748 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FEN1P39748 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FEN1P39748 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FEN1P39748 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FEN1P39748 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FEN1P39748 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FEN1P39748 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FEN1P39748 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FEN1P39748 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FEN1P39748 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FEN1P39748 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FEN1P39748 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FEN1P39748 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FEN1P39748 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FEN1P39748 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FEN1P39748 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FEN1P39748 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FEN1P39748 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FEN1P39748 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FEN1P39748 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FEN1P39748 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FEN1P39748 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FEN1P39748 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FEN1P39748 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FEN1P39748 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FEN1P39748 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FEN1P39748 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FEN1P39748 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FEN1P39748 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FEN1P39748 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FEN1P39748 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FEN1P39748 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FEN1P39748 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FEN1P39748 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FEN1P39748 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FEN1P39748 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FEN1P39748 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FEN1P39748 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FEN1P39748 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FEN1P39748 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FEN1P39748 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FEN1P39748 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FEN1P39748 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FEN1P39748 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FEN1P39748 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FEN1P39748 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FEN1P39748 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FEN1P39748 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FEN1P39748 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FEN1P39748 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FEN1P39748 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FEN1P39748 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FEN1P39748 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FEN1P39748 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FEN1P39748 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FEN1P39748 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FEN1P39748 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FEN1P39748 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FEN1P39748 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FEN1P39748 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FEN1P39748 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FEN1P39748 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FEN1P39748 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FEN1P39748 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FEN1P39748 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FEN1P39748 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FEN1P39748 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FEN1P39748 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FEN1P39748 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FEN1P39748 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FEN1P39748 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FEN1P39748 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FEN1P39748 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FEN1P39748 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FEN1P39748 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FEN1P39748 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FEN1P39748 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FEN1P39748 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FEN1P39748 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FEN1P39748 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FEN1P39748 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FEN1P39748 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FEN1P39748 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms