Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGFBR1P36897 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGFBR1P36897 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR1P36897 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR1P36897 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR1P36897 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR1P36897 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms