Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RORAP35398 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RORAP35398 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RORAP35398 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RORAP35398 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RORAP35398 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RORAP35398 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RORAP35398 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RORAP35398 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RORAP35398 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RORAP35398 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RORAP35398 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RORAP35398 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RORAP35398 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RORAP35398 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RORAP35398 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RORAP35398 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RORAP35398 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RORAP35398 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RORAP35398 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RORAP35398 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RORAP35398 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RORAP35398 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RORAP35398 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RORAP35398 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RORAP35398 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RORAP35398 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RORAP35398 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RORAP35398 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RORAP35398 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RORAP35398 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RORAP35398 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RORAP35398 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RORAP35398 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RORAP35398 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RORAP35398 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RORAP35398 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RORAP35398 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RORAP35398 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RORAP35398 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RORAP35398 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RORAP35398 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RORAP35398 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RORAP35398 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RORAP35398 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RORAP35398 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RORAP35398 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RORAP35398 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RORAP35398 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RORAP35398 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RORAP35398 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RORAP35398 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RORAP35398 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RORAP35398 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RORAP35398 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RORAP35398 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RORAP35398 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RORAP35398 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RORAP35398 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RORAP35398 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RORAP35398 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RORAP35398 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RORAP35398 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RORAP35398 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RORAP35398 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RORAP35398 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RORAP35398 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RORAP35398 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RORAP35398 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RORAP35398 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RORAP35398 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RORAP35398 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RORAP35398 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RORAP35398 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RORAP35398 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RORAP35398 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RORAP35398 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RORAP35398 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RORAP35398 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RORAP35398 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RORAP35398 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RORAP35398 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RORAP35398 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RORAP35398 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RORAP35398 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RORAP35398 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RORAP35398 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RORAP35398 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RORAP35398 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RORAP35398 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RORAP35398 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RORAP35398 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RORAP35398 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RORAP35398 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RORAP35398 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RORAP35398 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RORAP35398 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RORAP35398 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RORAP35398 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RORAP35398 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms