Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPDP35247 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPDP35247 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPDP35247 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPDP35247 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms