Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN7P35236 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN7P35236 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPN7P35236 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN7P35236 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms